Do zadań Referatu należą sprawy związane z ochroną tajemnicy państwowej i służbowej a w szczególności:

  1. Zapewnienie ochrony informacji niejawnych,
  2. Ochrona systemów i sieci informatycznych,
  3. Zapewnienie ochrony fizycznej Urzędu,
  4. Kontrola ochrony informacji niejawnych oraz przestrzegania przepisów o ochronie tych informacji,
  5. Okresowa kontrola ewidencji, materiałów i obiegu dokumentów,
  6. Opracowanie planu ochrony Urzędu i nadzorowanie jego realizacji,
  7. Szkolenie pracowników w zakresie ochrony informacji niejawnych.